塩基配列は何種類あるか,ご存じですか?
4つと答えた方,よくご存じです.
ACGTですよね.
5つと答えた方,こちら側の人ですね.
核酸の種類は指定していないので,DNAとRNAあわせるとACGTU.
でも実は,次世代シーケンサーで読むともっと多くの表記があるんです.
A Adenine アデニン
C Cytosine シトシン
G Guanine グアニン
T Tymine チミン
U Uracil ウラシル
の他に
R AG puRine
Y TC pYrimidine
M AC aMino
K TG Keto
S GC Strong
W AT Weak
B GCT Aの次
H ACT Gの次
V ACG TUの次
D AGT Cの次
N ATGC aNy
以上,16種類です.
んな無茶な.
プリン・ピリミジンからもう無茶な.
まぁ核酸としては5種類というのが正しい気はします.
僕の場合,一番見る塩基配列はおそらくNです.
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