AnonymousBlog

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さきちぃ
ゆうかりん
Berryz工房
あっきゃん

好きだった人が、どんどんと辞めていく。

道重
鞘師
かにょん
めいめい

アイコンだった、主役級の人もどんどんと辞めていく。
いや、勝負どころを変えている。
ポジティブな理由なのかネガティブな理由なのかはわからないし、他人が判断することじゃない。

本当に、諸行無常だなぁ。
今は今しかない。
今がいつ終わるかなんてわからない。

今何がしたいか。
今したいことをし続けることが大事。
続けられるうちしか続けられないのだから。

過去のことも、未来のことを考えるのは、可能性の広さの割に制御が効かない領域が多すぎて非効率。

とにかく、今に集中。
他のアイドルだって、いつどうなるかわからない。
僕だって来年はもうないんだし。
。。。。。

gVCF

VCFとは、Variant Call Fileという、多型情報を扱うフォーマット。
vCardというソフトもvcf形式を使っているので注意。

gVCFとは、genome VCFのこと。vcfに情報が追加されている。
gVCFは、多型サイトだけでなく、全サイトの情報を持つ。
それによって、コホートを結合して解析することができる。

参考
https://www.broadinstitute.org/gatk/guide/article?id=4017

塩基配列の種類

塩基配列は何種類あるか，ご存じですか？

4つと答えた方，よくご存じです．
ACGTですよね．

5つと答えた方，こちら側の人ですね．
核酸の種類は指定していないので，DNAとRNAあわせるとACGTU．

でも実は，次世代シーケンサーで読むともっと多くの表記があるんです．
A　Adenine　アデニン
C　Cytosine　シトシン
G　Guanine　グアニン
T　Tymine　チミン
U　Uracil　ウラシル

の他に

R　AG　puRine
Y　TC　pYrimidine
M　AC　aMino
K　TG　Keto
S　GC　Strong
W　AT　Weak
B　GCT　Aの次
H　ACT　Gの次
V　ACG　TUの次
D　AGT　Cの次
N　ATGC　aNy

以上，16種類です．
んな無茶な．
プリン・ピリミジンからもう無茶な．

まぁ核酸としては5種類というのが正しい気はします．
僕の場合，一番見る塩基配列はおそらくNです．

免許ゲット一歩手前

自動車学校卒業しました．
後は免許センター行くだけ．
急いた甲斐がありました．

去年の6月頃に85歳のおじいちゃんがよりにもよって新車を買ったんだとか．
そして夏にはアピタの駐車場の柱にぶつけたんだとか．
それっきりほとんど乗らなくなったらしい．

ほぼ新車状態（傷つき）の車を残して，去年の12月25日に逝去．

兄弟いとこ皆すでに車持ってるか，東京に住んでて要らないので僕が乗ることに．
そのために急いで免許取った．

自分勝手で好き勝手生きてる人だったから周りは苦労してたけど．
本人は絶対楽しかっただろうな．

形見が車とかUSBメモリーってのも，らしい．

ゴールデンウィークに車をとりに帰ろうかな．

ショウジョウバエ遺伝子の書き方

Genetic nomenclature for Drosophila melanogasterより
http://flybase.org/static_pages/docs/nomenclature/nomenclature3.html

遺伝子，アリル，変異体，トランスポゾンの名前とシンボルはイタリックで書く．

遺伝子名をフルネームで書くときはローマン（非イタリック）で書く．

タンパク質名とシンボルはローマンで書く．1文字目は大文字で．

遺伝子名のないタンパク質には決まったルールはない．
RNAの名前にも決まったルールはない．

種によってルールが違うらしいのが，進化学からするとナンセンスすぎる．
誰か統一したらいいのに．

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